 |
Доповіді НАН України. – 2009. – N 3. – С. 171–175.
Молекулярная модель взаимодействия 2'-5' олигоаденилатов с протеинкиназой С
А.В. Козлов, В.О. Китам, З.Ю. Ткачук
Анотація
Методом комп'ютерного моделювання побудована модель просторової структури
протеїнкінази С (ПКС) у вільному стані. З метою вивчення можливості
зв'язування з ПКС проведено in silico докінг ряду лігандів з білком
з використанням програми AutoDock 3.0. Показано, що 2'-5' олігоаденілати
зв'язуються в активному центрі та утворюють зв'язки з білком.
Порівняльний аналіз зв'язування, у тому числі мономерів — аденозину,
епоксіаденозину, виявив, що олігоаденілати можуть взаємодіяти
з обома цими центрами.
Повний текст статі в pdf-форматі
Molecular model of the interaction of 2'-5' oligoadenylates with protein kinase C
A.V. Kozlov, V.O. Kitam, Z.Yu. Tkachuk
Abstract
A model of the spatial structure of protein kinase C is built by the
computational modeling method. With the aim to explore the possibility of
the interaction of 2'-5' oligoadenylates with protein kinase
C in silico, a molecular docking of several ligands with protein kinase has
been performed using the AutoDock 3.0 program. It is shown that 2'-5'
oligoadenylates bind to the active center of protein kinase C and interact
with some groups of the protein. The comparative analysis of the binding of
oligoadenylates with monomers of adenosine and epoxyadenosine has revealed
that oligoadenylates can overlap both binding centers.
| Назад до номера | Вибір номера | Головна сторінка журналу | Головна сторінка Порталу |